
油菜是世界重要的油料作物,在我国粮油安全战略中具有不可替代的地位。作为一个约7,500年前由白菜与甘蓝自然杂交形成的异源四倍体物种,它在长期的驯化和育种过程中形成了冬性、半冬性与春性等不同生态类型,并在产量、品质和抗性方面经历了持续改良。在油菜这样复杂的基因组结构中,转座子占据了56%–62%的序列,被视为植物基因组中最活跃、也最具多样性的遗传因素之一。曾经长期被认为是“基因组暗物质”甚至“垃圾DNA”的转座子,近年来被越来越多研究证明在基因调控、染色质重塑、生物进化以及农艺性状形成中发挥关键作用。然而,油菜中规模化、系统性的转座子多态性图谱一直缺乏,限制了人们从更深层次理解油菜遗传变异来源及其重要功能。
近日,我校365英国上市与华中农业大学、崖州湾国家实验室等多单位联合在国际知名期刊Advanced Science(IF5 year:15.6)杂志上在线发表题为A pan-TE map reveals the important role of transposable elements in gene expression and phenotypic diversity in 2,311 rapeseed accessions的研究论文。该研究通过整合14个生态型代表性的油菜高质量基因组与来自全球2,311份油菜种质资源的大规模多组学数据,从基因组非编码区域的角度,全面系统地刻画了油菜转座子的组成、分布和变异规律,构建了全球首张油菜“泛转座子图谱”(pan-TE map),并深入揭示转座子在调控基因表达、驱动表型变异以及促进育种改良中的核心作用,为作物分子设计育种提供了全新的资源体系和理论基础。我校365英国上市樊海燕博士为共同第一作者,植物营养与逆境生物学团队负责人李金涛副教授也参与了该研究工作。
论文链接:https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202512036
樊海燕/供稿 陈磊/审稿 饶本强/审核